রাণীবাজার বালিকা উচ্চ বিদ্যালয়ের বিজ্ঞানাগারটি ০৩-১০-১৯৮৯ খ্রি: থেকে অদ্যবধি সুষ্ঠ ও সুন্দরভাবে পরিচালিত হচ্ছে। বিজ্ঞানাগারটি প্রতিষ্ঠানের একাডেমিক ভবনের ৩য় তলায় অত্যন্ত সুন্দর ও মনোরম পরিবেশে বিদ্যমান রয়েছে। বিজ্ঞানাগারটির আয়তন  (দৈর্ঘ্য ২০ ফুট ও প্রস্থ ১৮ ফুট) = ৩৬০ বর্গফুট। উক্ত বিজ্ঞানাগারটিতে প্রতিষ্ঠানের শিক্ষার্থীদের নিয়মিত ব্যবহারিক পাঠদানসহ শিক্ষার্থীদেরকে বিজ্ঞান মনোস্ক করে গড়ে তোলার ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ অবদান রাখছে।